O_epsilon_1 = Atom('o')
O_epsilon_2 = Atom('o')
H_epsilon_2 = Atom('h')
H_gamma_3 = Atom('h')
H_gamma_2 = Atom('h')
C_gamma = Atom('c')
C_delta = Atom('c')
C_beta = Atom('c')
H_beta_3 = Atom('h')
H_beta_2 = Atom('h')
bonds = [Bond(H_beta_2, C_beta), Bond(H_beta_3, C_beta), Bond(C_gamma, C_beta), Bond(H_gamma_2, C_gamma), Bond(H_gamma_3, C_gamma), Bond(C_delta, C_gamma), Bond(O_epsilon_1, C_delta), Bond(O_epsilon_2, C_delta), Bond(O_epsilon_2,H_epsilon_2),]
pdbmap = [('GLP', {'2HG': H_gamma_2, '2HB': H_beta_2, '3HG': H_gamma_3, '3HB': H_beta_3, 'CD': C_delta, 'CG': C_gamma, 'OE1': O_epsilon_1, 'CB': C_beta, 'OE2': O_epsilon_2, 'HE2': H_epsilon_2}, ), ]
amber_atom_type = {C_delta: 'C', O_epsilon_2: 'OH', C_gamma: 'CT', H_beta_3: 'HC', H_gamma_3: 'HC', O_epsilon_1: 'O', H_gamma_2: 'HC', C_beta: 'CT', H_beta_2: 'HC', H_epsilon_2: 'HO',}
amber12_atom_type = {C_delta: 'C', O_epsilon_2: 'OH', C_gamma: '2C', H_beta_3: 'HC', H_gamma_3: 'HC', O_epsilon_1: 'O', H_gamma_2: 'HC', C_beta: '2C', H_beta_2: 'HC', H_epsilon_2: 'HO',}
pdb_alternative = {'1HB': '3HB', '1HG': '3HG', 'HG1': '3HG', 'HB3': '3HB', 'HG3': '3HG', 'HB1': '3HB', 'HG2': '2HG', 'HB2': '2HB', '2HE': 'HE2', }
name = 'glu_sidechain_neutral'
